16 октября 1941 г., после двухмесячного сопротивления, части Красной армии оставили Одессу. На смену им пришли «солдаты невидимого фронта» — подпольщики-партизаны. Для организации подполья в Одессу направили профессионального разведчика Владимира Александровича Молодцова, действовавшего под псевдонимом Бадаев. Большие группы антифашистов укрылись в катакомбах — разветвлённых галереях подземных каменоломен, из которых веками добывали камень для строительства города. Задачей Молодцова было объединение действий ушедших в подполье партийных организаций, одесских чекистов, фронтовых разведгрупп, оставленных в тылу, и простых одесситов-па-триотов. Самым юным в группе Молодцова был 16-летний комсомолец Яша Гордиенко. Он собирал в городе информацию, распространял листовки, участвовал в диверсиях. Подпольщиков выдал предатель, и в феврале 1942 г. была арестована большая часть группы: Молодцов, Гордиенко, Софман, Волков, братья Музыченко, Шашглаш, Шевченко, Ме-гаш, Буньков и две Тамары — Межигурская и Шестакова. Подпольщиков страшно пытали, но никто не выдал товарищей, выдержал пытки и Яша. Всех героев казнили. Но одесские катакомбы до самого освобождения Одессы оставались очагом сопротивления.
18-летняя комсомолка Зоя Анатольевна Космодемьянская в октябре 1941 г. добровольно поступила в советскую диверсионную школу. Окончив её ускоренный курс, Зоя в ноябре успешно справилась с первым заданием — минированием дороги в районе Волоколамска. 17 ноября 1941 г. вышел жёсткий приказ Ставки сжигать населённые пункты в тылу врага, лишая захватчиков тёплого крова. О страданиях мирных жителей, которые также лишатся крова, тогда не думали — надо было спасать страну. Выполняя приказ, 27 ноября 1941 г. Зоя с товарищами в подмосковном селе Петрищево сожгли несколько домов, в которых квартировали немцы. Зою схватили, когда она, отстав от группы, вернулась в село, чтобы продолжить поджоги. Немцы нещадно пытали Зою, били, водили босиком по морозу, вырывали ногти, но Зоя даже своего имени не выдала, назвавшись Таней. Зою повесили 29 ноября 1941 г., собрав на казнь всех жителей деревни. Перед казнью Зоя крикнула: «Сколько нас ни вешайте, всех не перевешаете, нас 170 миллионов. Но за меня вам наши товарищи отомстят!». Посмертно Зою Космодемьянскую удостоили звания «Герой Советского Союза». Подвиг Зои стал символом сопротивления фашистам.
Летом 1941 г. немцы захватили деревню Лукино Новгородской области. Местные патриоты сформировали партизанский отряд и ушли в леса. К партизанам присоединился и 15-летний Лёня Голиков. В отряде он сражался наравне со взрослыми, участвовал в диверсиях, в боях с отдельными группами фашистов. Партизанский отряд держал в страхе захватчиков — на Псковщине, в своём глубоком тылу, немцы боялись ходить поодиночке. В августе 1942 г. Лёня из засады увидел немецкий автомобиль, явно везущий высокое начальство. Лёня гранатой подорвал машину, расстрелял из автомата немецких офицеров и забрал важные документы. За этот подвиг Голикова представили к званию Героя Советского Союза. Но Лёня не дожил до вручения награды — в январе 1943 г. он погиб в неравном бою в селе Острая Лука Псковской области.