Патриаршие палаты были сооружены русскими мастерами в 1653-1655 годах по велению патриарха Никона. Ранее на том же месте располагался патриарший двор. На первом этаже нового здания размещались хозяйственные службы, на втором – парадные помещения, а на третьем – личные покои патриарха.
В настоящее время на втором этаже Патриарших палат, где ранее собирался Священный Собор, разместилась музейная экспозиция, посвящённая русской культуре XVII столетия. Здесь можно увидеть драгоценную посуду, ювелирные украшения, предметы царской охоты, старинную мебель и уникальное шитьё.
Одно целое с Патриаршими палатами составляет собор Двенадцати апостолов – домовая церковь российских патриархов. Основной реликвией церкви является резной золоченый иконостас XVII-XVIII веков. Он был перенесён из Вознесенского собора Кремля в 1929 году.
Сейчас в церкви действует выставка икон XVII века. В экспозиции можно найти такие произведения как: икона «Федор Стратилат» Симона Ушакова, икона «Андрей Первозванный» Федора Зубова, икона «Распятие с апостольскими страстями» Федора Рожнова.