Находятся в сердце Азии и отделяют Западно-Сибирскую равнину и Среднесибирское плоскогорье от внутренних полупустынных и пустынных плоскогорий Центральной Азии. Сложнейшая система хребтов состоит из пиков Алтая, Западного и Восточного Саяна, Прибайкалья и Забайкалья, Станового и Яблоневого хребтов, Алданского нагорья и протягивается вдоль южных границ России от Иртыша до Приамурья на 4,5 тыс. км.
Хребты Южной Сибири появились давно. Прибайкалье и Забайкалье испытали горообразование при появлении байкальской складчатости (конец протерозойской и начало палеозойской эры), цепи Алтай и Саяны — каледонской и герцинской (палеозой). Позднее горы были разрушены. Хребты Сибири возродились из-за неотектонических движений, которые продолжаются до сих пор. За последние две сотни лет в горах Прибайкалья и Забайкалья произошло более 800 землетрясений. Некоторые достигали 9 баллов по шкале Рихтера.
Алтай, пожалуй, наиболее типичные горы Южной Сибири, которые представляют собой сложную систему хребтов, разделенных глубокими долинами рек и обширными котловинами. Высочайшей их вершиной является пик Белуха (4509 м). Своим названием он обязан обильным ледникам и снежникам.
Алтай — второй после Урала горнозаводской край России. Здесь находится множество месторождений рудных полезных ископаемых, а к северу от хребта раскинулся Кузнецкий каменноугольный бассейн (Кузбасс).
Укок — одно из самых труднодоступных мест Алтая. Здесь сходятся границы России, Монголии, Китая и Казахстана. Плато овеяно легендами: местные жители свято верят в то, что это место является пристанищем духов, и не ведут здесь никакой деятельности, кроме обрядовой.
Саяны — общее название двух горных систем (Западной и Восточной) на юге Сибири. Между хребтами находится более десятка различных по размерам и глубине котловин. Самая знаменитая из них — Абакано-Минусинская, она славится археологическими памятниками.
В горах Южной Сибири находятся два самых красивых и важных русских озера — Байкал и Телецкое. Первое возглавляет список глубочайших в России, второе — на 5-м месте в этом рейтинге. Телецкое озеро с чистой и прозрачной водой считается самым живописным в нашей стране. Территорию вокруг источника часто называют русской Швейцарией.
В горах Южной Сибири хорошо прослеживается высотная поясность. Здесь располагаются степи, таежные леса, субальпийские и альпийские луга, а также горная тундра.
Степи находятся на различных высотах и часто сильно отличаются растительностью. На холмистых предгорьях — злаки (ковыль, типчак, тонконог) и разнотравье (ветреница, герань, ирис), повыше, где более влажно, добавляются кустарники жимолости, таволги, шиповника и бобовника.
В лесах произрастают в основном хвойные породы: лиственница, ель, сосна, пихта и кедр. Чаще остальных встречается лиственница. Выше 700 м она растет более разреженно, из-за чего солнечные лучи свободно проникают к земле — травяной покров здесь более густой. Сосна есть только в предгорьях и выше 700 м не появляется.
До высоты 3 тыс. м раскинулись альпийские и субальпийские луга, которые используются в качестве горных пастбищ. Выше лежит тундра с характерной для нее флорой: мох, лишайник, редкая низкорослая березка
Растительность Алтайских гор насчитывает более 1,8 тыс. видов, из них 212 эндемиков. Здесь распространены высокогорные, лесные и степные формы жизни. На севере и северо-западе в предгорьях равнинные степи переходят в горные степи и лесостепи. На склонах господствуют леса, которые с ростом высоты сменяют субальпийские луга. «Король» алтайских лесов — кедр.
Животный мир региона разнообразен. В высокогорных степях обитают антилопа дзерен, горный баран (архар), снежный барс (ирбис), тушканчик-прыгун, монгольский сурок, даурская и монгольская пищухи. Из птиц изредка встречаются индийский гусь, монгольский мохноногий канюк, монгольская дрофа, саджа. В каменистой тундре (до высоты 3000 м) водится белая куропатка, а в альпийских и субальпийских лугах — горный конек, алтайский вьюрок, красноклювая галка и др. Алтайский улар, или алтайская горная индейка, — эндемик Алтая. Она плохо летает и старается избегать леса.
Еще в XIX в. алтайский архар был распространен широко, однако под влиянием человека его численность начала сокращаться. Сейчас горный баран обитает в альпийских лугах и горной тундре подальше от людей.
Изредка в горах сибирского юга можно встретить северного оленя. Среди грызунов отмечены алтайская пищуха и сурок, а также алтайская высокогорная полевка — эндемик данного региона.
Горная Сибирь богата пушниной. Шкурки баргузинского соболя — самый ценный мех региона. Также встречаются пышнохвостые белки, косули рыси, бурые медведи.